La maladie de Gaucher est une maladie de stockage lysosomale résultant de mutations du gène GBA1. Une partie des patients développent une encéphalopathie progressive (nGD) qui n’est pas intégralement représentée dans les modèles in vivo. Dans l’étude des neuropathologies, les interactions entre les neurones, astrocytes et microgliocytes suscitent un intérêt grandissant. Notre objectif était de reproduire les atteintes multicellulaires neurales et gliales associées à la nGD. Autrement, d’identifier des marqueurs connus de la pathologie et de vérifier leur véracité à différentes échelles tissulaires et cellulaires. Pour se faire, nous avons développé un nouveau modèle d’organoïdes cérébraux contenant des cellules microgliales, dérivées à partir d’iPSCs d’individus sains et de patients nGD. Une des difficultés majeures a été d’appréhender l’hétérogénéité inhérente au modèle organoïde et à la nGD. Dans ce cadre, plusieurs approches de colorations et d’immunomarquages histologiques sur coupes et tissus transparisés ont été confrontées. Les résultats obtenus montrent que le développement cellulaire et structurel des organoïdes nGD n'a pas été affecté mais nous avons observé des anomalies cytologiques. Plus précisément, les défauts dans l'intégrité des organelles indiquent une autophagie défectueuse. Nous avons également observé la présence d'astrocytes réactifs. La question est maintenant de comprendre comment ces mécanismes contribuent aux lésions neuronales.