L’analyse tridimensionnelle d’un échantillon par Serial Block Face Imaging trouve ses champs d’application dans l’étude de la micro-anatomie et la biologie du développement. Le concept est de produire une grande quantité d’images directement à partir de la surface d’un bloc dans lequel est inclus l’échantillon, et ce, au fur et à mesure de sa coupe (au microtome ou cryostat). Les images sériées sont de fait déjà pré-alignées et permettent de reconstruire en trois dimensions l’échantillon et de l’explorer selon n’importe quel plan de coupe virtuel. La plateforme MicroPICell et la société Kaer Labs collaborent afin de reproduire cette technique, avec une caméra amovible comprenant une source d’excitation LED intégrée, positionnée en face d’un microtome ou d’un cryostat classique. A partir d’organes soit inclus en paraffine colorée soit congelés et enrobés dans de l’OCT, cette technique nous a permis d’acquérir des images en série grâce au contraste de fluorescence entre l’échantillon et le milieu d’enrobage. Nous avons pu ensuite faire une reconstruction 3D de ces échantillons, en conservant leurs structures. Par rapport aux systèmes commerciaux disponibles, ce système est peu onéreux, demande une préparation simple des échantillons et est adaptable aussi bien pour des échantillons inclus en paraffine qu’en congelé.