Avec l’avènement des produits d’immunothérapie, l’analyse du microenvironnement tumoral (TME) est devenue essentielle. Cette caractérisation est nécessaire pour expliquer le mode de fonctionnement de ces produits, pour éventuellement expliquer leur potentielle toxicité et surtout pour tenter de stratifier les patients qui auront accès à ces nouvelles thérapies. Pour cette analyse du TME, différentes techniques existent, avec leurs avantages et leurs inconvénients. Dans cette présentation, nous avons étudié les atouts et les limites des techniques que nous utilisons au quotidien : l’immunohistochimie multiplexe quantitative et l’analyse par cytométrie de flux. Nous avons comparé ces deux techniques sur des échantillons communs et sur différents marqueurs de cellules immunitaires. Les paramètres que nous avons étudiés sont : la quantification absolue de marqueurs intra-tumoraux, l’étude des proportions relatives des cibles par analyses multiplexes et la localisation de ces marqueurs. Nous avons également comparé les marqueurs utilisés dans ces deux techniques sur deux populations tumorales murines distinctes. Les résultats obtenus nous ont permis de comparer ces deux techniques qui restent complémentaires. Ces différences sont importantes à connaître, surtout dans le paysage de l’immunothérapie, pour déterminer la méthode la mieux adaptée aux questions scientifiques qui nous sont posées par nos clients chercheurs qui développent de nouvelles thérapies.